Els avantatges de l'estratègia de producció just-in-time (JIT) estan ben documentades, però també poden tenir greus inconvenients. El principal problema d’aquest procés de producció queda palès en el seu nom. "Just in time" significa que l'èxit d'aquesta estratègia comercial depèn en gran mesura d'una coordinació precisa entre les empreses i els seus proveïdors per garantir un lliurament ràpid. Com que no hi ha cap amortidor d'inventari, les empreses poden patir molt si es retarda qualsevol element de producció.
L’estratègia de producció de JIT significa que les empreses no produeixen articles a la venda fins que no han estat ordenats pels clients, és a dir, que l’inventari és baix o inexistent. Si bé un baix inventari pot ser beneficiós per a la línia de fons d'una empresa de diverses maneres, el desenvolupament d'una empresa d'aquesta manera requereix una gran coordinació. Des d’obtenir les matèries primeres necessàries per a la fabricació fins a garantir el lliurament oportú, tots els aspectes de la producció de JIT s’han de sincronitzar. Sovint això significa que les empreses han d’invertir en la implementació de la tecnologia de la informació per permetre la notificació automàtica als proveïdors quan es reben les comandes.
Sota els models de producció basats en inventaris, les empreses realitzen grans comandes de materials de majoristes i es poden produir molts articles amb un enviament. A mesura que la producció s’esgoti el primer enviament de matèries primeres, s’envia una altra comanda, creant un amortidor de temps convenient. La producció a demanda significa que les empreses han de trobar proveïdors que estiguin disposats a complir comandes petites i freqüents amb un avís molt curt, cosa que sovint significa utilitzar proveïdors locals per reduir el temps i les despeses d’enviament. Si no existeixen fons d’inventari o materials, qualsevol problema de la cadena de subministrament pot provocar retards en el lliurament i enutjar els clients. L’augment sobtat del preu de les mercaderies primeres per problemes amb l’abastiment de materials, l’escassetat, el desastre natural o el trastorn polític (anomenat xoc de subministrament) també pot suposar una amenaça seriosa per a la capacitat d’una empresa de donar servei eficaç als seus clients.
Com que la producció de JIT es basa completament en comandes existents, no és el sistema més eficient per fer front a allò inesperat. Una empresa que utilitza aquesta estratègia pot estar mal equipada per fer front a un sobtat de demanda de producte. La manca d’inventari de còpia de seguretat significa que els clients han d’esperar que l’empresa rebi subministraments i fabriqui el producte. Això pot suposar retards ampliats, clients insatisfets i possibles despeses de la part de tota una comanda si es plantegen problemes de la cadena de subministrament.
La incapacitat de complir grans comandes de manera puntual pot costar diners per a negocis, però hi ha altres despeses ocultes inherents a l'estratègia JIT que són tan importants, encara que menys dramàtiques. Produir productes per a la venda en quantitats més petites suposa gastar menys per l'enviament de matèries primeres, però en realitat pot acabar costant més a una empresa. Les empreses amb nivells de producció elevats es beneficien de l’economia d’escala: a mesura que augmenta la producció, el cost mitjà de producció de cada producte disminueix. Això és parcial perquè les grans compres a l'engròs sovint tenen descomptes generosos basats en la quantitat. Les empreses que utilitzin l'estratègia de producció de JIT poden pagar més per article, ja que han de realitzar comandes més petites i més freqüents que no s'acceptin per a aquests tipus de ruptures de preus. Les despeses d’enviament i lliurament addicionals que acompanyen la comanda més freqüent també poden tenir un impacte important tant en la línia de fons com en el medi ambient.
